暂无
上海智能电子有限公司

使用NIST“仪表板”工具,现在更容易进行可靠的RNA分析

2019-11-24

  美国国家标准技术研究院(NIST)的一个新的创新“仪表盘”不会帮助您驾驶汽车,但将有助于进行可重复的生物学研究。

  在最近的《自然通讯》杂志上,国际多实验室团队演示了一种新的软件工具“ erccdashboard”,用于评估用于研究基因表达的实验方法的性能。该分析工具设计用于由NIST托管的外部RNA控件联盟(ERCC **)开发的RNA插入控件。这些ERCC对照品是由该机构于2013年发布的用于外部RNA对照品的DNA序列库(标准参考材料2374)生产的。

  “在基因表达实验中,科学家试图通过同时量化该基因组表达的数千个RNA分子,来了解细胞的生物活性是如何从其基因组中包含的遗传信息中产生的,”《自然通讯》论文的主要作者萨拉·芒罗说。

  Munro说,erccdashboard提供的验证对于确保这些复杂的实验可重现至关重要。她说:“基因表达实验的结果通常用于做出医疗决定,例如确定哪种药物最适合特定患者。” “我们的新软件工具使研究人员能够评估其方法在任何实验中的性能,评估随时间推移以及在实验室之间进行实验的可重复性和可重复性,并使结果值得信赖。”

  erccdashboard为任何实验室评估其基因表达分析质量提供了第一个标准化方法。ERCC插入控制材料源自NIST SRM 2374,它由96个不同的DNA分子组成,每个分子都有特定的认证基因序列。可以将这种DNA产生的独特RNA分子以一定比例的“鸡尾酒”混合在一起,然后用于“掺入” RNA分子的生物样品。RNA“刺入”分子充当对照以检查实验的技术性能。为了避免干扰对样品RNA分子的测量,ERCC对照RNA序列被设计为不同于许多研究人员研究的哺乳动物细胞(例如人或小鼠细胞)中发现的RNA序列。

  Munro说,以前,没有标准的,技术独立的方法来分析从基因表达实验中获得的数据。她解释说:“ ERCC控制材料使我们开发新方法验证工具erccdashboard成为可能。”

  Munro说,新的NIST软件为生物学家评估任何基因表达实验提供了一种简单的“交钥匙”机制。她说:“其性能指标被设计为与实验所用的测量技术类型无关,因此可以随技术的进步而比较结果。” “使用仪表板将能够进行可重复的研究,并防止研究人员从低质量的实验数据中得出错误的结论。”

  Munro说,开发仪表板的NIST团队的下一个目标是应用该软件来分析ERCC当前正在开发的一套新的RNA控制分子。最终,该团队计划扩展该工具以用于蛋白质测量。

上一篇:NIST报告和致命芝加哥房屋大火的视频细节动态
下一篇:确保质量:NIST建议对生物技术产品进行新的纯度测试